Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIPA1L1O43166 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIPA1L1O43166 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms