Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN4O15554 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN4O15554 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms