Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FANCAO15360 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FANCAO15360 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FANCAO15360 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCAO15360 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCAO15360 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCAO15360 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FANCAO15360 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FANCAO15360 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCAO15360 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FANCAO15360 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FANCAO15360 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FANCAO15360 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FANCAO15360 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FANCAO15360 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCAO15360 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCAO15360 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCAO15360 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCAO15360 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCAO15360 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCAO15360 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCAO15360 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCAO15360 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCAO15360 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCAO15360 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCAO15360 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCAO15360 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCAO15360 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCAO15360 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCAO15360 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCAO15360 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCAO15360 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms