Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN3O15232 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN3O15232 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN3O15232 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN3O15232 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN3O15232 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN3O15232 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN3O15232 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN3O15232 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN3O15232 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms