Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN6O15212 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms