Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VILLO15195 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VILLO15195 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VILLO15195 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VILLO15195 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VILLO15195 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VILLO15195 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VILLO15195 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VILLO15195 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VILLO15195 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VILLO15195 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VILLO15195 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VILLO15195 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VILLO15195 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VILLO15195 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VILLO15195 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VILLO15195 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VILLO15195 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VILLO15195 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VILLO15195 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VILLO15195 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VILLO15195 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VILLO15195 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VILLO15195 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VILLO15195 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VILLO15195 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VILLO15195 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VILLO15195 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms