Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ANKRD28O15084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms