Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR3AO14802 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms