Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CITO14578 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CITO14578 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CITO14578 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CITO14578 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CITO14578 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CITO14578 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CITO14578 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CITO14578 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CITO14578 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CITO14578 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CITO14578 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CITO14578 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CITO14578 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CITO14578 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CITO14578 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CITO14578 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CITO14578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CITO14578 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CITO14578 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms