Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 FOX2YKR009C 2703 nt5.84□□□□□ -1.47
YRF1-4O13559 DAL81YIR023W 2913 nt5.84□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 CBF5YLR175W 1452 nt5.84□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 BSC5YNR069C 1470 nt5.84□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 KRE28YDR532C 1158 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUT1YGL162W 900 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 MAK3YPR051W 531 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 MAL11YGR289C 1851 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 GLT1YDL171C 6438 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 LYP1YNL268W 1836 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUP35YDR172W 2058 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 DCD1YHR144C 939 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 RRN9YMR270C 1098 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUE1YPR151C 621 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 AVO1YOL078W 3531 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 PRP40YKL012W 1752 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 CRT10YOL063C 2874 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 PEX7YDR142C 1128 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 UBI4YLL039C 1146 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 CDS1YBR029C 1374 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 COX17YLL009C 210 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 YNL228WYNL228W 777 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 MNN4YKL201C 3537 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 ALG6YOR002W 1635 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 PTR2YKR093W 1806 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 CAF4YKR036C 1932 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 RXT3YDL076C 885 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 TAF11YML015C 1041 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 SAP4YGL229C 2457 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 TAH18YPR048W 1872 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 YOR1YGR281W 4434 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 CDC4YFL009W 2340 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 DPB4YDR121W 591 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 GSP2YOR185C 663 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 PEX32YBR168W 1242 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 KGD1YIL125W 3045 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 AKL1YBR059C 3327 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 YGL152CYGL152C 678 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-4O13559 FRS1YLR060W 1788 nt5.77□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 snR17bsnR17b 332 nt5.77□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 SSB2YNL209W 1842 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 PCT1YGR202C 1275 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 BUD16YEL029C 939 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 PHO86YJL117W 936 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YPR109WYPR109W 885 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 GDB1YPR184W 4611 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 UBA1YKL210W 3075 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RVB1YDR190C 1392 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YLH47YPR125W 1365 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 ISY1YJR050W 708 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 DSC2YOL073C 969 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YPL245WYPL245W 1365 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RCK2YLR248W 1833 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 SNA2YDR525W-A 240 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 PIC2YER053C 903 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 ARP1YHR129C 1155 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RHO3YIL118W 696 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YKL023WYKL023W 834 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 SEC17YBL050W 879 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 YMD8YML038C 1329 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 GAD1YMR250W 1758 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 OCA5YHL029C 2040 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 HOS1YPR068C 1413 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 PWP1YLR196W 1731 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 CYM1YDR430C 2970 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 MED4YOR174W 855 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 CLB4YLR210W 1383 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 CPS1YJL172W 1731 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 RRN3YKL125W 1884 nt5.71□□□□□ -1.49
YRF1-4O13559 CPR4YCR069W 957 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 TMA17YDL110C 453 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 MTF1YMR228W 1026 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 PEP5YMR231W 3090 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 NMD3YHR170W 1557 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 SRG1SRG1 551 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 YDR396WYDR396W 501 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 FRA2YGL220W 363 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 COA3YJL062W-A 258 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 ARO7YPR060C 771 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 snR32snR32 188 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 SYP1YCR030C 2613 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 RBA50YDR527W 1320 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 GSY1YFR015C 2127 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 FOB1YDR110W 1701 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-4O13559 URA7YBL039C 1740 nt5.7□□□□□ -1.5
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