Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX7O00628 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX7O00628 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX7O00628 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX7O00628 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX7O00628 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX7O00628 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX7O00628 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms