Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL22O00626 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL22O00626 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL22O00626 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL22O00626 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL22O00626 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL22O00626 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL22O00626 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL22O00626 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL22O00626 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL22O00626 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL22O00626 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms