Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIP1O00291 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIP1O00291 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIP1O00291 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIP1O00291 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIP1O00291 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIP1O00291 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIP1O00291 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIP1O00291 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIP1O00291 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIP1O00291 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIP1O00291 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HIP1O00291 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIP1O00291 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIP1O00291 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIP1O00291 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIP1O00291 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIP1O00291 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIP1O00291 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIP1O00291 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIP1O00291 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIP1O00291 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HIP1O00291 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIP1O00291 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIP1O00291 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms