Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIEO00221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIEO00221 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms