Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHODO00212 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHODO00212 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHODO00212 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHODO00212 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHODO00212 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHODO00212 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHODO00212 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHODO00212 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHODO00212 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHODO00212 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RHODO00212 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms