Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
I3L4J1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
I3L4J1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
I3L4J1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
I3L4J1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
I3L4J1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
I3L4J1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
I3L4J1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
I3L4J1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
I3L4J1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
I3L4J1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
I3L4J1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
I3L4J1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
I3L4J1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
I3L4J1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
I3L4J1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
I3L4J1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
I3L4J1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
I3L4J1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
I3L4J1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
I3L4J1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
I3L4J1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
I3L4J1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms