Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BNC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BNC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms