Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMKR1H3BMG3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms