Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF26H0Y7S4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF26H0Y7S4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms