Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms