Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms