Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP99D6REC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms