Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DBX1A6NMT0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DBX1A6NMT0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms