Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT2A6NK58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms