Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB15A6NHN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB15A6NHN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms