Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NDN8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NDN8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A6NDN8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A6NDN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NDN8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NDN8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NDN8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A6NDN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A6NDN8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A6NDN8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A6NDN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A6NDN8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NDN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NDN8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NDN8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NDN8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms