Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNDIG1LA6NDD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms