Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS37CA5D8V6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms