Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC162PA2VCL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms