Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POTEB3A0JP26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POTEB3A0JP26 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms