Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms