Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms