Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMA1Q9UHB6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms