Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms