Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms