Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNPLA8Q9NP80 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms