Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms