Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC13A1Q9BZW2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms