Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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