Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms