Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms