Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms