Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms