Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms