Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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