Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms