Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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