Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms