Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms