Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms